Về hoàn thuế, tại Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11, Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14, Nghị định số 20/2017/NĐ-CP, Nghị định số 68/2020/NĐ-CP và Nghị định số 132/2020/NĐ-CP quy định về quản lý thuế đối với các doanh nghiệp có giao dịch liên kết hiện không có quy định về hoàn thuế đối với mức trần chi phí lãi vay được khấu trừ mà doanh nghiệp liên kết đã nộp thuế thu nhập doanh nghiệp (thừa) trong năm 2017-2018 mà chỉ quy định cho bù trừ với số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp trong 5 năm tiếp theo từ năm 2020 đến hết năm 2024.
Căn cứ khoản 2 Điều 2 Nghị định số 68/2020/NĐ-CP ngày 24/6/2020 của Chính phủ sửa đổi, bổ sung Khoản 3 Điều 8 Nghị định số 20/2017/NĐ-CP ngày 24/2/2017 của Chính phủ quy định về quản lý thuế đối với doanh nghiệp có giao dịch liên kết thì người nộp thuế được áp dụng ngưỡng khấu trừ lãi vay theo quy định sửa đổi, bổ sung đối với kỳ tính thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2017, 2018 để xác định lại số thuế phải nộp, tiền chậm nộp tương ứng.
Người nộp thuế xác định lại chi phí lãi vay theo tỷ lệ 30% (sau khi trừ lãi tiền gửi, lãi cho vay) mà có số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp, tiền chậm nộp đã nộp ngân sách Nhà nước của năm 2017, 2018 (xác định chi phí lãi vay theo tỷ lệ 20% trước đây) lớn hơn số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp, tiền chậm nộp xác định lại thì phần chênh lệch được bù trừ vào số thuế thu nhập doanh nghiệp từ năm 2020 đến hết năm 2024. Kết thúc năm 2024, không xử lý số thuế còn lại chưa khấu trừ hết.
